Yamaha 著名的四气缸中型跑车 FZR400 系列是国内也有着一定认知度的车型，尽管这个认知度并不完全是好的：由于缺乏必要的零件和针对性的维护，“ 流落 ” 到国内的 FZR400 系列二手车，普遍都得面对着要么水温高、要么热车之后加不起油，还有化油器等等的 “ 内伤 ”，被扔到角落边是常见的状况。FZR 车系是 Yamaha 自与 Honda 的在上世纪八十年代初的大战之后，渐渐重新 “ 回血 ” 的产品之一：尽管此前的几十年里，Yamaha 已经在 WGP 世界锦标赛里拿下了多个冠军头衔，但在量产车领域里，有着全套整流罩的跑车（此前日本制造商的运动车型，除了极个别的高价格车型之外，大众化价格的就只有半包围的产品）则是从八十年代才正式开始的，而四冲程领域里的第一批产品，就是 FZR 系列。FZR400 系列的前身，可追溯到 1984 年首次发布的 FZ400 系列：FZ400R 是带有半边前整流罩的街跑车风格，而 FZ400N 则属于运动街车的风格。该车搭载一副水冷四冲程直列四气缸、DOHC 每气缸四气阀、排气量 399 cc 的发动机，最大马力输出 59 匹。前 16、后 18 英寸直径的车轮，是当个时代里的特色之一。
新推出的 FZ400 随后参与到全日本道路锦标赛第一届 TT-F3 级别的比赛中（TT-F1 是 750 级别的量产车型赛事，该级别后来演变为的 WSB/World Superbike 和今天的 WorldSBK 超级跑车世界锦标赛），并拿下了冠军。配合着当时日本经济快速发展的大环境，赛事极大地推动了跑车市场的发展，让此前与 Honda 的本土市场大战中元气大伤的 Yamaha 渐渐获得了恢复。而 TT-F3 级别随后也被分为几乎无限制改装的 SS400 和严格限制改装的 SP400，以求进一步地扩大跑车市场。原本只有半幅整流罩的 FZ400 也从赛事中演变成了接下来的 FZR400 之雏形，而使用第一代 Deltabox 特制车架的工厂赛车则被称之为 YZF-400 —— 今年的比赛里用什么样的车，在某程度上就预示着未来的一、两年里，量产车的基本轮廓。
1986 年，第一代的 FZR400（工厂编号 1WG）正式发布，除了最大马力输出仍为 59 匹的水冷四冲程直列四气缸发动机之外，配备了第一代的 EXUP 排气阀控制系统、Deltabox 轻量化车架，是新车重要亮点。此外，车轮规格也更换为前 17、后 18 英寸。
1987 FZR400 是上一版本的延续，仅修改了车体的图案/贴花。同时还追加推出了单座位设计、限量生产 2500 台的 FZR400R（工厂编号 2TK）。与标准款相比，R 版的发动机内部换装了轻量化设计的活塞、经过强化的离合器以及与 TT-F3 赛车相同规格的变速齿轮箱，脚踏也采用了往后 40 mm 的设计。
1988 年，第二代 FZR400/FZR400R（工厂编号 3EN）发布。第二代的 FZR400/FZR400R 有着一个现代跑车的外观造型，FAI 进气系统的两根 “ 洗衣机管 ” 算得上是一个亮眼的设计。动力单元仍是直列四气缸、最大马力 59 匹的机器，且沿用了第一代前 17、后 18 英寸车轮的设计。
1989 年推出的 FZR400/FZR400R 是 1988 第二代车型的换图案版本，机械规格没有变化，沿用了原有的水冷四冲程直列四气缸、排气量 399 cc、最大动力输出 59 匹的发动机。与日本另外三家制造商的同级对手相比，FZR400 系列的动力单元有一个贯穿了整个车系生产周期的设计特点：气缸组采用了大前倾角（气缸组侧视图中心线与垂直线之间的夹角），第一代、第二代车型的发动机采用了前倾 45 度、第三代采用了前倾 35 度的设计。其他日本制造商同级产品的动力单元都有前倾，但前倾的角度明显小得多。而 Yamaha 选择了这一设计，是看中了该设计为车体所带来的低重心，以及进气系统更接近于直吸状态。Yamaha 今天的跑车、其动力单元都有着一定程度的前倾，但已经没有了 FZR400 时代那么大的角度；此外，在市售越野赛车 YZ450F、YZ250F 的动力单元上采用相反的、反向后倾的气缸组设计，其目的同样就是为了对应越野应用的重心运用、以及迎面式的直接进气。
1988 年开始，FZR400/FZR400R 登陆美国市场、不再仅限于日本本土市场的销售。但较低的排气量（相对于 FZR600 而言）、相对较高的价格，让 FZR400 在美国市场的销售只是持续至 1991 年的前后。
1989 年的第二十八届东京车展上，Yamaha 展示了新一代（第三代）的 FZR400RR/FZR400RR SP。第三代的 FZR400RR 工厂编号为 3TJ、次年一月 18 日开始正式上市。这一代车型是 FZR400 系列的最终版，1994 年发布了最后一次更新之后就渐渐走向全面停产。第三代 FZR400RR 搭载一副经过全新设计的水冷四冲程直列四气缸、最大动力输出 59 匹（1993 版开始是 53 匹）的发动机，气缸组采用了前倾 35 度的设计，厂方称这是来自 YZF400 工厂赛车的赛道技术，与经过修改的 Deltabox 车架搭配之下，新设计的发动机具有更佳的操控性。车体方面，粗壮的、全新设计的车架极为显眼，尺寸上能够媲美 YZF400；全新设计的投影式前大灯，前后轮框直径也修改为前后 17 英寸（上一代是前 17、后 18 英寸）。
同步推出的 FZR400RR SP，1990 款限量生产 1000 台，强化了的散热器（水箱）、赛车变速比的齿轮箱、可调的前后悬挂系统、单座位的设计，是 SP 版与标准版的主要差异之处。1992 年十二月发布的 FZR400RR SP，机械规格没有变化，换了新的车体图案，限量生产 500 台；1994 年二月发布的 FZR400RR SP 是这一车型的最后一次更新、限量生产 500 台，随着中型跑车在日本市场的没落（日本本土的 TT-F3 比赛也在 1993 年终止），当时没有同步推出标准款车型的更新。随着日本的中型跑车市场走向衰落，随后各制造商推出的车型，基本就是面向欧美和新兴市场为主。
